血培养阳性肉汤直接药敏试验的临床性能评价研究杨硕 王启 卢洪飞 王晓娟 张雅薇 李曙光 孟涵 张菲菲 王占伟 陈宏斌 等
中华检验医学杂志2023年 46卷 06期
DOI: 10.3760/cma.j.cn114452-20230202-00060
目的
评价血培养阳性肉汤直接药敏试验的临床性能,为优化临床血流感染抗菌药物使用策略提供依据。
方法
回顾性研究。对北京大学人民医院2017年5月至2021年12月的780份血培养阳性标本,采用血培养阳性肉汤直接纸片扩散法进行直接药敏试验,结果与实验室常规药敏试验结果对比分析,药敏判断折点参照临床和实验室标准化协会(CLSI)M100 S32文件。
结果
排除53份2种以上菌株生长后,革兰阴性菌331株(主要为大肠埃希菌139株、肺炎克雷伯菌79株、铜绿假单胞菌35株、鲍曼不动杆菌21株),革兰阳性球菌396株(主要为金黄色葡萄球菌25株、凝固酶阴性葡萄球菌316株、肠球菌属47株)。与实验室常规药敏试验进行比较,全部革兰阴性菌分类一致(CA)率为86.0%(1 368/1 591)、重大错误(ME)率为8.7%(139/1 591)、极重大错误(VME)率为0.5%(8/1 591);全部革兰阳性球菌CA%为89.2%(960/1 076)、ME%为7.5%(81/1 076)、VME%为1.0%(11/1 076);大肠埃希菌中亚胺培南的CA%为16/17,美罗培南的CA%为90.1%(109/121),头孢吡肟的CA%为70.8%(85/120);肺炎克雷伯菌中亚胺培南的CA%为10/13,美罗培南的CA%为80.9%(55/68),头孢吡肟的CA%为80.3%(53/66);铜绿假单胞菌中美罗培南的CA%为96.0%(24/25);鲍曼不动杆菌中美罗培南的CA%为16/16;金黄色葡萄球菌中利奈唑胺的CA%为100%(25/25),头孢西丁的CA%为100%(24/24);凝固酶阴性葡萄球菌中利奈唑胺的CA%为98.9%(269/272),头孢西丁的CA%为94.5%(277/293),庆大霉素的CA%为71.6%(194/271);肠球菌属中万古霉素的CA%为91.5%(43/47),氨苄西林的CA%为94.7%(36/38)。
结论
与常规药敏试验相比,血培养阳性肉汤直接药敏试验在常见革兰阴性菌、革兰阳性球菌中有较高的分类一致率和较低的误差率,能够成为临床血流感染抗菌药物药敏试验的另一种快速的替代方法。
肠道定植碳青霉烯耐药肠杆菌目细菌的发生率及其发生血流感染的危险因素研究孟涵 王启 梁馨月 杨硕 王占伟 张菲菲 王辉
中华检验医学杂志2023年 46卷 06期
DOI: 10.3760/cma.j.cn114452-20230127-00047
目的
了解碳青霉烯耐药肠杆菌目细菌(CRE)的定植率,及其引起血流感染的比例和危险因素。
方法
回顾性研究。2018年1月至2021年12月在北京大学人民医院检验科进行直肠拭子CRE筛查的患者共4 993例,其中筛查阳性患者137例,收集阳性患者的临床和实验室资料,分析高风险人群CRE筛查的阳性率、定植菌种类、抗菌药物耐药性及定植患者CRE血流感染的危险因素。CRE筛查阳性与转为血流感染危险因素的单因素分析使用χ2检验,多因素分析采用二元logistic回归,以相对危险度(OR)及其95%置信区间(CI)表示,双侧P<0.05为差异有统计学意义。病原菌耐药率采用WHONET 5.6软件分析。
结果
研究期间,共4 991例进行直肠拭子筛查的患者符合入组条件,其中137例患者筛查阳性,阳性率为2.7%(137/4 991),其中重症监护病区和血液科病区阳性率较高,分别为5.5%(27/493)和3.3%(109/3 321)。CRE筛查阳性患者共分离出145株定植菌,分别为肺炎克雷伯菌63株(43.4%,63/145)、大肠埃希菌52株(35.9%,52/145)、阴沟肠杆菌16株(11.0%,16/145)和其他肠杆菌目细菌14株(9.7%,14/145),CRE筛查阳性定植菌以产金属β内酰胺酶为主。分析145株定植菌对22种抗菌药物的耐药性,对阿米卡星和替加环素敏感度最高。137例筛查阳性患者中,14例(10.2%,14/137)转为血流感染,共分离14株病原菌,其中肺炎克雷伯菌10株、大肠埃希菌4株,以产丝氨酸碳青霉烯酶为主。同一患者血流感染分离菌株与其前期筛查菌株产酶类型和抗菌药物耐药性高度一致。将CRE筛查阳性患者与CRE转为血流感染患者相比较,单因素分析中手术史、中性粒细胞减少、造血干细胞移植、直肠拭子筛查前抗菌药物使用史、入院48 h筛查、菌株产丝氨酸碳青霉烯酶差异有统计学意义(P<0.05)。多因素分析中,手术史(OR值为24.659,95%CI 2.540~239.411,P=0.006)和中性粒细胞减少(OR值为93.796,95%CI 6.294~1 397.804,P=0.001)差异有统计学意义(P<0.05)。
结论
CRE在我院患者体内定植率较低,但筛查阳性患者转为血流感染的比例较高,手术史和中性粒细胞减少是定植转为血流感染的危险因素,应加强对高风险病区及易感患者的监控和防治。
高通量筛选靶向革兰阴性菌BamA蛋白的小分子药物初步研究佘鹏飞 李泽浩 刘莎莎 李懿敏 李琳惠 杨艺钒 周林颖 伍勇
中华检验医学杂志2023年 46卷 06期
DOI: 10.3760/cma.j.cn114452-20221114-00678
目的
通过高通量筛选获得针对革兰阴性杆菌BamA外膜蛋白的小分子抗菌药物。
方法
6株鲍曼不动杆菌临床菌株于2022年1—12月分离自中南大学湘雅三医院住院患者。基于分子对接试验,利用sybyl-X2.1软件对Chemdiv化合物数据库中的小分子化合物进行高通量虚拟筛选;对高通量筛选打分排名靠前的150个小分子进行体外生物学试验筛选,选取具有最佳抗菌活性的前4个小分子进行深入的分子对接分析,并选取对接分数最高的小分子8308-0401进行后续试验;通过棋盘稀释试验检测8308-0401与利福平的联用抗菌效果;最后,通过等离子表面共振试验检测8308-0401与靶蛋白BamA的亲合力。
结果
通过高通量虚拟筛选,发现了排名靠前的150个小分子的对接打分平均为5.63;通过体外生物学试验,发现了小分子8308-0401、8365-1335、C066-2507和L582-0346具有较强的抗菌活性;其中,8308-0401具有最高的分子对接分数,且与利福平联用对鲍曼不动杆菌标准菌株和临床菌株均具有协同抗菌活性;8308-0401与靶蛋白BamA具有较强的亲合力,其结合常数为182 μmol/L。
结论
小分子8308-0401可靶向革兰阴性杆菌BamA外膜蛋白而发挥抗菌活性。
lycosin-Ⅰ体外抗耐甲氧西林金黄色葡萄球菌活性及联合药敏试验陈恒冰 王玲 胡敏
中华检验医学杂志2023年 46卷 06期
DOI: 10.3760/cma.j.cn114452-20230418-00443
目的
探究lycosin-Ⅰ体外抗耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的活性及体外联合8种常用抗菌药物对MRSA的抗菌作用。
方法
本研究遵循了随机对照试验的设计原则。收集中南大学湘雅二医院2021年9至11月临床分离的MRSA 10株,采用微量肉汤稀释法测定lycosin-Ⅰ体外抗MRSA的最低抑菌浓度(MIC)、最小杀菌浓度(MBC)和杀菌动力学试验;采用微量肉汤棋盘式稀释法检测lycosin-Ⅰ与青霉素、红霉素、左氧氟沙星、庆大霉素、利福平、米诺环素、万古霉素及利奈唑胺共8种常见抗菌药物的体外联合抑菌效果。
结果
lycosin-Ⅰ体外抗MRSA的MIC范围为4~8 mg/L,MIC50和MIC90分别为4和8 mg/L;MBC范围为4~8 mg/L,其比值MBC/MIC为1~2;杀菌动力学试验结果显示,lycosin-Ⅰ浓度为1/2 MIC或MIC时,MRSA临床分离株和标准菌株均在短时间存活菌数下降而后出现恢复繁殖的现象,而浓度为2 MIC或4 MIC时存活细菌载量则呈现逐渐减少直至杀灭的趋势。lycosin-Ⅰ与庆大霉素体外联用时以协同作用为主而与其他抗菌药物联用主要表现为相加作用。此外,lycosin-Ⅰ与抗菌药物体外联用后可显著降低抗菌药物的MIC50和MIC90。
结论
lycosin-Ⅰ在体外对MRSA具有较好的抑菌和杀菌活性且杀菌快速、彻底,同时与其他抗菌药物体外联合抗MRSA时,能起到协同或相加作用。
基于MALDI-TOF MS的不同机器学习模型对肺炎克雷伯菌亚胺培南药物敏感性预测的诊断效能比较程菡 刘刚 张丽霞 王琴 朱彧
中华检验医学杂志2023年 46卷 06期
DOI: 10.3760/cma.j.cn114452-20230420-00204
目的
机器学习是人工智能的一个重要分支及支撑技术,本研究拟比较基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)技术的4种肺炎克雷伯菌对亚胺培南药物敏感性机器学习预测模型的诊断效能。
方法
回顾性研究。收集2019年1月至2020年12月天津市海河医院检验科微生物室临床标本中分离的684株肺炎克雷伯菌的MALDI-TOF MS质谱峰和亚胺培南药敏数据,从中按照简单随机方法选取亚胺培南敏感株和耐药株各70株的质谱峰数据作为训练集,以及敏感株和耐药株各30株建立测试集模型,对上述200份标本的质谱峰数据经归一化处理后进行正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)后,再分别通过最小绝对值选择与收缩算子(LASSO)、逻辑回归(LR)、支持向量机(SVM)和神经网络(NN)算法建立训练集数据模型,通过网格搜索算法和10折交叉验证选取最好的训练集和测试集模型曲线下面积(AUC)和混淆矩阵,通过测试集混淆矩阵验证预测模型的正确率。
结果
OPLS-DA分析的R²Y和Q²分别为0.546 3和0.017 8,最优的LASSO、LR、SVM和NN算法训练集和测试集的AUC分别为1.000 0和0.858 1、1.000 0和0.820 1、0.940 8和 0.756 1、1.000 0和0.697 2,训练集模型对耐药预测准确率分别为99%(69/70)、100%(70/70)、91%(64/70)和100%(70/70),药物敏感预测准确率分别为100%(70/70)、100%(70/70)、90%(63/70)和100%(70/70),正确率分别为99%(139/140)、100%(140/140)、91%(127/140)和100%(140/140),经测试集验证分别对耐药预测准确率为93%(28/30)、87%(26/30)、60%(18/30)和60%(18/30),药物敏感预测准确率分别为100%(30/30)、80%(24/30)、93%(28/30)和67%(20/30),正确率分别为97%(58/60)、83%(50/60)、77%(46/60)和63%(38/60)。
结论
LASSO算法建立的肺炎克雷伯菌对亚胺培南药物敏感性预测模型具有较高的诊断效能,具有潜在的临床辅助决策支持能力。
Y染色体丢失在多发性骨髓瘤患者中的临床意义马艳婷 沈敏娜 陈朴 姜惠琴 黄斐 张春燕 潘柏申 王蓓丽 郭玮
中华检验医学杂志2023年 46卷 06期
DOI: 10.3760/cma.j.cn114452-20230209-00083
目的
探究Y染色体丢失(LOY)在多发性骨髓瘤(MM)患者中的风险分层及预后意义。
方法
回顾性分析2018年1月至2020年1月复旦大学附属中山医院收治的193例男性初诊MM患者的临床资料,根据初诊染色体核型结果分成正常核型组(178例)与伴LOY核型组(15例)。采用秩和检验、2×2列联表卡方检验和独立样本t检验比较2组间肝肾功能、免疫组化和细胞遗传学等实验室检查结果、治疗疗效及生存预后等情况,通过生存分析及Cox回归探究LOY的临床预后。
结果
初诊男性MM患者LOY的发生率为8%(15/178)。伴LOY组的修订的国际分期系统(R-ISS)Ⅲ期患者比例(8/15)高于正常核型组(40/178)(χ2=7.052,P<0.01),且发生1q21扩增的比例(10/13)高于正常核型组(77/162)(χ2=4.159,P<0.05)。正常核型组在完成第4周期化疗后达到完全缓解(CR)/严格意义的完全缓解(sCR)的比例(63/171)高于伴LOY组(1/15)(χ2=5.564,P<0.05),发生疾病进展(PD)的比例(16/171)也低于伴LOY组(4/15)(χ2=4.306,P<0.05)。伴LOY组MM患者的2年无进展生存期(PFS)较正常核型组短(Z=‒3.201,P<0.01)。单因素生存分析结果显示,肌酐≥93 μmol/L、β2微球蛋白(β2-MG)≥4.0 mg/L、血清游离轻链比值(sFLC)<0.06、骨髓浆细胞(BMPC)比例≥30%、R-ISS Ⅲ期、化疗4周期后未达CR/sCR及伴LOY、1q21扩增、P53缺失和t(4;14)遗传学异常的初诊MM患者PFS缩短(P均<0.05);Cox回归分析显示,肌酐≥93 μmol/L(HR=4.460,95%CI 1.615~12.314,P=0.004)、sFLC<0.06(HR=2.873,95%CI 1.206~6.849,P=0.017)、化疗4周期后未达CR/sCR(HR=3.522,95%CI 1.437~8.634,P=0.006)及伴LOY(HR=3.485,95%CI 1.473~8.249,P=0.006)为影响初诊MM患者PFS的独立危险因素。
结论
LOY对初治MM患者的疗效与预后有重要的临床意义,是不良预后的独立危险因素,或可成为新型的临床评估指标。