社区获得性致下肢气性坏疽ST660型肺炎克雷伯菌全基因组测序及毒力特征分析刘周 杭修兵 储雯雯 李昕 叶乃芳 周强
中华检验医学杂志2021年 44卷 09期
DOI: 10.3760/cma.j.cn114452-20210530-00335
目的
对1株致下肢气性坏疽肺炎克雷伯菌(KPN)进行全基因组测序及毒力特性分析,为认识致社区获得性重症感染KPN分子毒力特征提供参考。
方法
患者于2018年3月13日进入急诊科治疗,主要临床症状为高热、左下肢气性坏疽及糖尿病酮症酸中毒。取患者脓液标本进行分离培养、菌株鉴定、高黏表型及药敏检测。对菌株进行全基因组测序并分析其多位点序列分型、荚膜分型、质粒分型、毒力及耐药基因。通过接合及消除试验分析质粒特征。血清杀菌试验及大蜡螟感染模型分析菌株毒力表型,双样本t检验比较待测菌株和对照菌株对大蜡螟幼虫半数致死率(LD50)差异。
结果
检出菌株KPN41053,仅对氨苄西林耐药,高黏表型阴性。KPN41053染色体总长5 377 071 bp,属于ST660型,荚膜型为K16;携带一个IncFIB(K)/HI1B型毒力质粒(207 506 bp),质粒包含多种毒力因子且序列与pLVPK高度相似,但其中rmpA和rmpA2均为假基因。该质粒接合试验阴性。通过质粒消除获得变异株KPN41053_PC。毒力表型分析显示,KPN41053为血清抗性(6级),而KPN41053_PC为血清中度敏感(3级),KPN41053对大蜡螟幼虫的lgLD50与高毒力对照株(ST23-K1型)差异无统计学意义(t=0.32,P=0.765),低于KPN41053_PC(t=5.97,P=0.004)。
结论
KPN41053为1株属于ST660型且高黏表型阴性的非典型高毒力KPN,毒力质粒为其关键毒力因子。KPN可导致糖尿病患者发生社区获得性气性坏疽。
食源性腹泻弯曲菌快速鉴定方法评估及耐药性检测刘畅 杨静 赵建玉 周倩倩 隋文君 杨会娟 鲁辛辛
中华检验医学杂志2021年 44卷 09期
DOI: 10.3760/cma.j.cn114452-20210126-00069
目的
研究并评估适合临床实验室开展的食源性腹泻弯曲菌检测方法及抗菌药物敏感性试验。
方法
分为预实验和大样本验证。(1)预实验:收集2017年9月至2018年1月就诊于北京地区某三甲医院食源性腹泻患者粪便标本400份。采用双孔滤膜培养法及改良头孢哌酮-木炭-脱氧胆酸盐(CCD)琼脂培养法在微需氧环境中培养48 h,挑选可疑菌落进行基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)鉴定,同时进行实时荧光定量聚合酶链反应(qPCR)检测空肠弯曲菌及结肠弯曲菌。(2)大样本验证:收集2018年4月至2019年3月就诊于北京不同地区不同级别3家医院肠道门诊食源性腹泻患者粪便标本2 062份,进行qPCR检测及培养。阳性菌株按照美国临床与实验室标准化协会及美国国家肠道细菌耐药监测中心推荐的纸片扩散法及琼脂稀释法进行药物敏感性试验并进行结果判读。采用卡方检验比较3种检测方法的检测结果及2种抗菌药物敏感性试验的一致性。
结果
预实验中qPCR、双孔滤膜培养法及改良CCD琼脂培养法检测弯曲菌(空肠弯曲菌/结肠弯曲菌)的检出率分别是9.0%(36/400)、5.0%(20/400)和3.5%(14/400),差异有统计学意义(χ²=11.772,P<0.01)且qPCR阴性,培养法均为阴性。大样本验证中,qPCR的检出率为8.1%(168/2 062),其中空肠弯曲菌7.0%(144/2 062),结肠弯曲菌1.2%(24/2 062)。qPCR阳性标本进行双孔滤膜培养法培养,阳性率为61.9%(104/168),其中空肠弯曲菌为58.3%(84/144),结肠弯曲菌为83.3%(20/24),与预实验检出率差异无统计学意义(P>0.1)。空肠弯曲菌和结肠弯曲菌对环丙沙星耐药率分别为94.0%(94/100)和100.0%(24/24),对红霉素耐药率分别为6.0%(6/100)和33.3%(8/24),两种抗菌药物敏感性试验方法一致性较好(Kappa值>0.75)。
结论
qPCR快速、灵敏、操作简单,适合临床实验室常规开展。双孔滤膜培养法检出率显著高于改良CCD琼脂培养法,弯曲菌对喹诺酮类药物显示出极高的耐药率,已不适用于北京地区弯曲菌食源性腹泻的治疗,应选择大环内酯类抗菌药物。
生长分化因子15和降钙素原在脓毒症中的诊断与预后价值分析李欢 陈娟娟 胡元慧 蔡馨 汤冬玲 张平安
中华检验医学杂志2021年 44卷 09期
DOI: 10.3760/cma.j.cn114452-20210208-00095
目的
探讨生长分化因子15(GDF15)和降钙素原(PCT)在脓毒症中的诊断与预后价值。
方法
选取2020年7月至2021年1月在武汉大学人民医院ICU就诊的脓毒症患者137例(脓毒症组)和有炎症感染但未诊断为脓毒症的患者59例(非脓毒症组),再选取同时期健康体检者62名(对照组)。脓毒症患者根据入院28 d生存情况分为死亡组(48例)和存活组(89例)。检测所有研究对象的血清GDF15、PCT、C反应蛋白(CRP)、白介素6(IL-6)和白介素10(IL-10)水平,并动态监测脓毒症患者入院第1、3、7天各个指标的水平,利用非参数检验比较不同分组之间两个指标的差异,用Spearman相关检验分析脓毒症患者GDF15与PCT之间的相关性,绘制受试者工作特征(ROC)曲线评价2个指标对脓毒症的诊断及预后价值。
结果
脓毒症组、非脓毒症组和对照组的GDF15水平分别为3.22(1.39,6.31)、0.84(0.21,1.66)和0.11(0.09,0.13)μg/L,PCT水平分别为13.10(1.99,50.25)、0.24(0.13,0.68)和0.05(0.03,0.10)μg/L,CRP水平分别为115.80(26.40,184.07)、24.20(11.30,53.20)和0.50(0.50,2.76)mg/L,IL-6水平分别为68.26(21.59,255.46)、33.20(10.81,89.27)和8.82(7.33,11.23)ng/L,IL-10水平分别为11.30(5.88,25.50)、9.34(5.65,16.90)和4.94(4.31,5.31)ng/L,脓毒症组的GDF15、PCT、CRP和IL-6显著高于非脓毒症组(U值分别为67.681、86.034、44.164和38.934,P均<0.05)和对照组(U值分别为136.475、138.667、120.701和100.886,P均<0.001),脓毒症组的IL-10与非脓毒症组比较差异无统计学意义,但高于对照组(U=80.221,P<0.001)。脓毒症患者的GDF15和PCT呈正相关,Spearman相关系数为0.234(P=0.006)。死亡组和生存组的GDF15分别为5.49(3.60,8.25)μg/L和2.03(1.06,3.69)μg/L,PCT水平分别为26.45(11.23,94.25)μg/L和9.08(1.33,22.75)μg/L,死亡组的GDF15和PCT均显著高于存活组(U值分别为3 305.500和3 060.000,P均<0.001)。第1、3、7天死亡组的GDF15与PCT水平均高于存活组(P<0.05),而CRP和IL-10水平差异无统计学意义(P>0.05)。死亡组第3和第7天的IL-6水平高于存活组(P<0.05)。GDF15、PCT、CRP、IL-6和IL-10单独及联合诊断脓毒症的曲线下面积(AUC)分别为0.899、0.938、0.874、0.789、0.698和0.962;GDF15、PCT、CRP、IL-6和IL-10单独及联合检测对脓毒症预后的AUC分别为0.774、0.716、0.522、0.623、0.520和0.839。
结论
GDF15和PCT在脓毒症的鉴别诊断和预后均有良好的临床参考价值,指标联合后临床价值更高,GDF15可能成为脓毒症的诊断和预后的生物标志物。
全自动化学发光法筛查孕产妇和新生儿梅毒特异性抗体的结果分析孟改利 王琪 赵侃侃 康茹 于壮 杨军兰 谢云
中华检验医学杂志2021年 44卷 09期
DOI: 10.3760/cma.j.cn114452-20210112-00030
目的
分析孕产妇和新生儿梅毒抗体分布的现状以及探讨如何通过设置检测灰区优化现有的孕产妇和新生儿梅毒筛查流程。
方法
对2015至2018年就诊于西北妇女儿童医院的119 531例孕产妇和21 275例新生儿的血清标本采用化学发光法检测梅毒特异性抗体(TPAb)的初筛结果及采用梅毒螺旋体明胶颗粒凝集试验(TPPA)和梅毒快速血浆反应素诊断试验(RPR)的复检结果进行回顾性分析。数据分析采用χ²检验、Fisher精确概率法和趋势χ²检验。
结果
孕产妇和新生儿TPAb初筛阳性率分别为0.69%(825/119 531)和1.24%(264/21 275),总体复检阳性率分别为0.32%(380/119 531)和0.90%(191/21 275),总体可疑梅毒现患率分别为0.13%(161/119 531)和0.31%(67/21 275);2015至2018年孕产妇和新生儿总体可疑梅毒现患率均呈逐年增高的趋势(χ2=9.860,P=0.002;χ2=5.311,P=0.021)。孕产妇和新生儿TPPA和TPAb阳性符合率均随S/CO值的升高而增高(χ2=614.833,P<0.001;P<0.001);若新生儿TPAb S/CO≥7.00或孕产妇TPAb S/CO≥15.00,TPAb结果有效性等同于TPPA。孕产妇和新生儿可疑梅毒现患率也随S/CO值的升高而升高(χ2=323.059,P<0.001;P<0.001);孕产妇TPAb S/CO为3.00或新生儿TPAb S/CO为5.00,可疑梅毒现患率均为0,可初步排除梅毒感染。
结论
本地区孕产妇可疑梅毒现患率呈逐年增高的趋势,应进一步加强孕早期梅毒筛查和干预治疗,提高优生优育率。全自动化学发光分析法作为孕产妇和新生儿梅毒初筛方法假阳性高,可根据本研究建立的检测灰区优化梅毒筛查流程,以期防止漏检,同时降低假阳性率,避免临床误诊。
六种新型冠状病毒核酸检测试剂的性能评价及其与核酸提取试剂匹配性分析于河山 任峰 张艺凡
中华检验医学杂志2021年 44卷 09期
DOI: 10.3760/cma.j.cn114452-20201229-00933
目的
通过比较6种新型冠状病毒(2019-nCoV)核酸检测试剂的最低检出限、扩增效率、特异性、准确度以及与6种核酸提取试剂匹配性分析,为选择核酸提取试剂、扩增试剂以及临床诊疗提供科学依据。
方法
将国家标准物质进行浓度梯度稀释得到6个浓度梯度,用广州达安、北京金豪、武汉明德、四川迈克、江苏硕世和上海之江6种2019-nCoV核酸检测试剂(分别简写为DA、JH、MD、MK、SS、ZJ)检测靶基因,评价其最低检出限、扩增效率、准确度、特异性等性能。阳性质控品水平1、2(低中浓度)分别用6种核酸提取试剂提取(编号a~f)搭配6种2019-nCoV核酸检测试剂检测靶基因,比较不同核酸提取试剂和不同核酸检测试剂之间匹配情况,采用双因素方差分析。
结果
DA、JH、MD、SS试剂核衣壳蛋白(N)基因最低检出限为7.0×102拷贝数/ml;JH、MD、SS、MK试剂开放阅读框架1ab(ORF1ab)基因最低检出限为9.39×102拷贝数/ml;MK、ZJ试剂包膜蛋白(E)基因最低检出限为5.03×102拷贝数/ml;SS试剂N基因扩增效率89%,ORF1ab基因扩增效率为90%,扩增效率最高。6种2019-nCoV核酸检测试剂特异性均100%;a、b、c、d提取试剂与6种核酸检测试剂匹配性好,但a提取试剂更适合搭配SS、MK和ZJ核酸检测试剂(P<0.05),d提取试剂更适合搭配MD、SS、DA、JH和MK核酸检测试剂(P<0.05),e提取试剂更适合搭配SS核酸检测试剂(P<0.05),f提取试剂更适合搭配DA、JH核酸检测试剂(P<0.05),e和f试剂不适合搭配MK和ZJ。
结论
6种核酸检测试剂性能良好,实验室根据实际情况选择合适的提取试剂和检测试剂搭配使用。
肠杆菌科细菌黏菌素及多黏菌素B药敏试验的方法学比较刘智慧 林宇岚 邓通哲 陈善建 曾勇彬 刘晓倩 陈守涛 张维清 陈霞 杨滨
中华检验医学杂志2021年 44卷 09期
DOI: 10.3760/cma.j.cn114452-20201212-00897
目的
以微量肉汤稀释法为金标准,评价4种不同药敏方法检测多黏菌素敏感性的性能,为实验室选择可常规开展的药敏方法及临床合理用药提供参考。
方法
收集福建医科大学附属第一医院2019年1—12月临床标本分离的88株非重复肠杆菌科细菌(其中6株携带mcr-1基因),分别用微量肉汤稀释法、黏菌素肉汤纸片洗脱法(CBDE)、Vitek-2™药敏分析系统、BD PhoenixTM药敏分析系统、商品化微量肉汤稀释法检测多黏菌素的MIC值。以微量肉汤稀释法为金标准,分析不同方法的基本一致性、分类一致性、极重大错误和重大错误;采用Kappa一致性检验、配对χ²检验及Spearman秩相关法对4种药敏方法与金标准之间的一致性进行统计分析。
结果
与金标准相比,CBDE、Vitek-2™药敏分析系统、BD PhoenixTM药敏分析系统和商品化微量肉汤稀释法的基本一致性分别为94.32%(83/88)、92.05%(81/88)、90.90%(80/88)和96.59%(85/88),分类一致性均为100%(88/88),未出现极重大错误和重大错误;4种药敏方法与金标准的检测结果差异无统计学意义(McNemer检验P=1),检测多黏菌素敏感性的一致性较强(Kappa=1,P<0.001);4种药敏方法测定的MIC值与微量肉汤稀释法均呈正相关,一致性较好(r均>0.5,P均<0.05)。
结论
多黏菌素4种药敏方法在本实验室均达到了临床和实验室标准协会及欧洲抗菌药物敏感性试验委员会联合推荐的性能标准,其中商品化微量肉汤稀释法、CBDE检测性能表现最佳,目前可应用于本院临床微生物实验室日常工作中。