克林霉素诱导耐药B族链球菌同源性分析及耐药基因研究高晶 汪雅萍 蒋南燕 彭怡倩 刘璐 仉英 陈艺升 应春妹
中华检验医学杂志2018年 41卷 01期
DOI: 10.3760/cma.j.issn.1009-9158.2018.01.007
目的
研究克林霉素诱导耐药B族链球菌(GBS)的同源性和耐药基因,为临床预防和治疗克林霉素诱导耐药GBS感染提供依据。
方法
收集2014年1月至2015年12月复旦大学附属妇产科医院GBS 921株,使用VITEK2-compact全自动细菌药敏仪检测这些菌株对7种抗菌药物的敏感性,挑选红霉素耐药、克林霉素敏感或中介的D-抑菌圈试验阳性菌株63株,采用多位点序列分型方法确定菌株序列型,使用PCR方法检测红霉素耐药基因mefA和ermB,分析耐药性、多位点序列分型和耐药基因的相关性。
结果
921株GBS中红霉素耐药率53.4%(492/921株),克林霉素耐药率50.2%(462/921株),左氧氟沙星耐药率34.7%(320/921株),呋喃妥因耐药率7.5%(69/921株);63株克林霉素诱导耐药GBS菌株左氧氟沙星耐药率27.0%(17/63株),未检出青霉素、万古霉素和呋喃妥因耐药的菌株;克林霉素诱导耐药GBS菌株包含12种ST型,以ST12(31.7%)(20/63株)和ST19(25.4%)(16/63株)最常见,发现一个新的ST型:ST1072;ST19左氧氟沙星耐药率(75.0%)(12/16株)较其他ST型更高;63株GBS中mefA、ermB检出率分别为27.0%(17/63株)和41.3%(26/63株)。
结论
本研究检出克林霉素诱导耐药的GBS具有遗传多样性,不同ST型耐药性及相关耐药基因的检出亦有显著差异。(中华检验医学杂志,2018, 41:24-28)
烧伤患者产NDM-1型金属β-内酰胺酶肺炎克雷伯菌的碳青霉烯类抗生素耐药机制研究杜芳玲 梅艳芳 刘盼盼 万腊根 魏丹丹 曹先伟 文江雄 向天新 刘洋
中华检验医学杂志2018年 41卷 01期
DOI: 10.3760/cma.j.issn.1009-9158.2018.01.008
目的
探讨烧伤患者感染肺炎克雷伯菌对碳青霉烯类抗生素高水平耐药的分子机制。
方法
采用回顾性分析方法,收集南昌大学第一附属医院2014年7月至2015年6月烧伤患者分离的非重复碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(CR-KP)18株。测定菌株最低抑菌浓度(MIC),对菌株进行特异性PCR扩增和序列分析、质粒接合试验、Southern杂交以及外膜蛋白分析。多位点序列分型(MLST)分型技术和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析菌株同源性。
结果
药敏试验显示所有碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(CR-KP)具有多重耐药,对哌拉西林/他唑巴坦、头孢曲松、左氧氟沙星、环丙沙星、庆大霉素、妥布霉素、头孢替坦、头孢他啶、头孢吡肟、氨曲南、亚胺培南、美罗培南全部耐药,耐药率100%(18/18);对替加环素、复方新诺明、阿米卡星对耐药率分别为0%(0/18)、61.1%(11/18)、72.2%(13/18)。接合试验可使受体菌大肠埃希菌J53对碳青霉烯的MIC值从≤0.0625或0.125 μg/ml上升到16或32 μg/ml。特异性PCR扩增和序列分析发现18株产NDM-1菌株,5株KPC-2菌株。接合试验证实blaNDM-1可以通过质粒传播。Southern杂交显示blaNDM-1基因定位于46Kb大小的质粒上,质粒复制子分型显示为IncX3型。PFGE共7种细菌基因型,而MIST分型发现18株CR-KP分别属于ST11、ST395、ST17、ST37、ST263、ST14和ST76型。外膜蛋白的SDS-PAGE和ompK35/36基因序列分析发现ST11、ST395和ST37型CR-KP菌株OmpK36膜孔蛋白缺失,而其他ST分型菌株OmpK36膜孔蛋白表达量降低。
结论
本院烧伤患者分离的肺炎克雷伯菌对碳青酶烯类药物高水平耐药的主要机制是质粒介导的NDM-1型金属β-内酰胺酶的产生合并OmpK36膜孔蛋白表达降低或缺失,并且发现了同时携带NDM-1和KPC-2种碳青霉烯酶的肺炎克雷伯菌。(中华检验医学杂志,2018, 41:29-34)
两种产毒型艰难梭菌分子诊断方法的临床应用评价庄国华 宋小军 许星星 罗芸 黄忱 叶菊连 蔡剑 王丽倩 许向军 王贤军 等
中华检验医学杂志2018年 41卷 01期
DOI: 10.3760/cma.j.issn.1009-9158.2018.01.009
目的
通过与Xpert C.difficile/Epi检测临床粪便样本中艰难梭菌毒素基因方法的对比,系统评价实验室研发的艰难梭菌毒素基因多重荧光PCR检测方法的性能。
方法
2016年8月1日至12月30日采集杭州市余杭区第一人民医院和宁波市鄞州人民医院临床腹泻患者粪便样本176份,平行采用Xpert C.difficile/Epi和实验室研发的检测方法进行检测,同时进行艰难梭菌分离培养和PCR毒素鉴定。采用SPSS 20.0软件对检测结果进行交叉表分析。
结果
以Xpert C.difficile/Epi检测结果为标准,本实验室研发方法的敏感度为91.7%(22/24)、特异度为100%(152/152)、阳性预测值为100%(22/22)、阴性预测值为98.7%(152/154),两种方法检测结果的一致性好(Kappa=0.950,P<0.001)。以厌氧分离培养和PCR毒素检测结果为标准,本实验室研发方法的敏感度为90.0%(18/20)、特异度为97.0%(152/156)、阳性预测值为81.8%(18/22)、阴性预测值为98.7%(152/154)(Kappa=0.838,P<0.001);Xpert C.difficile/Epi的敏感度为90.0%(18/20)、特异度为96.0%(150/156)、阳性预测值为75.0%(18/24)、阴性预测值为98.7%(150/152)(Kappa=0.792,P<0.001)。
结论
实验室研发的艰难梭菌毒素基因多重荧光PCR检测方法与Xpert C.difficile/Epi检测性能基本一致,可直接用于临床腹泻标本中产毒型艰难梭菌检测。该方法的临床应用为国内临床艰难梭菌感染病例的诊断提供一种国产化的检测方法。(中华检验医学杂志,2018, 41:35-40)
血清miR-122-5p和miR-486-5p在肝癌诊断中的临床应用何佳 肖斌 杭建峰 杨永泉 李林海 孙朝晖
中华检验医学杂志2018年 41卷 01期
DOI: 10.3760/cma.j.issn.1009-9158.2018.01.010
目的
探讨肝癌患者血清miR-122-5p和miR-486-5p的表达水平,及两指标单独或与甲胎蛋白(AFP)联合诊断肝癌的临床应用价值。
方法
采用病例对照研究。选择2016年6月至2017年3月在广州军区广州总医院住院的60例肝癌患者(HCC组),20例肝炎患者(肝炎组),20例肝硬化患者(肝硬化组),20例乳腺癌患者(乳腺癌组),20例胃癌患者(胃癌组)及20名健康体检人员(正常对照组),提取总RNA,采用实时荧光定量PCR技术,检测血清中miR-122-5p和miR-486-5p的相对表达量。用受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic,ROC)分析miRNA对肝癌诊断的特异度和灵敏度,并与肿瘤标志物AFP的测定结果进行比较。根据ROC曲线下面积判断诊断效能,评估其在肝癌诊断中的应用价值。各组间比较采用非参数秩和检验进行分析。
结果
肝癌组、肝炎组、肝硬化组、乳腺癌组、胃癌组及健康对照组中血清miR-122-5p的相对表达量分别是0.14(0.05~0.51)、0.45(0.32~0.58)、0.53(0.34~0.67)、0.14(0.07~0.28)、0.29(0.13~0.36)和0.73(0.63~0.95),血清miR-486-5p的相对表达量分别是0.50(0.23~0.77)、0.62(0.48~0.82)、0.65(0.54~0.85)、0.23(0.08~0.40)、0.29(0.15~0.45)和0.76(0.69~1.23)。肝炎组、肝硬化组、肝癌组中血清miR-122-5p的相对表达量较健康对照组低,差异均有统计学意义(U值分别为315.37,393.46,429.08, P均<0.01),肝炎组、肝硬化组、肝癌组中血清miR-486-5p的相对表达量较健康对照组较低,差异均有统计学意义(U值分别为103.67,156.18,207.35,P均<0.05)。单项检测HCC时,AFP的敏感度最高(73.7%),miR-122-5p的特异度最高(95%)。双项检测HCC时,AFP+miR-122-5p的敏感度最高(93%),miR-122-5p和miR-486-5p的特异度最高(70%),AFP+miR-122-5p的联合检测与单项AFP相比,AUC差异有统计学意义(Z=3.02,P<0.01),而AFP+miR-486-5p及miR-122-5p+miR-486-5p较AFP单项检测AUC差异无统计学意义(Z=1.57,1.39,P均>0.05)。三项联合检测时,敏感度和特异度分别为96.5%和55%,ROC曲线下面积AUC为0.891(95%CI:0.818~0.964),三项联合检测时高于单独检测,且与AFP、miR-122-5p及miR-486-5p相比,AUC差异均有统计学意义(Z=3.26,3.72,4.25,P均<0.01)。
结论
血清miR-122-5p和miR-486-5p有可能成为肝癌辅助诊断的血清学标志物。(中华检验医学杂志,2018, 41:41-46)
临床回报CD8+T细胞结果与CD8lowT和CD8highT细胞亚群的相关性研究陈亚利 傅雅静 唐甜 赵雯 王亚男 耿文清 姜拥军 张子宁
中华检验医学杂志2018年 41卷 01期
DOI: 10.3760/cma.j.issn.1009-9158.2018.01.011
目的
探讨临床全自动分析平台回报CD8+T细胞结果与CD8lowT、CD8highT细胞亚群结果的关系。
方法
采用横断面研究,收集2015年12月至2016年9月中国医科大学附属第一医院临床患者及健康人群淋巴细胞亚群流式检测数据1 316例,其中恶性肿瘤患者287例,自身免疫病患者389例,健康人320名,HIV感染者320例,得到全自动分析平台回报的CD8+T细胞结果。流式检测数据同时采用FlowJo软件画门,分析上述患者CD8lowT、CD8highT细胞亚群结果,与临床全自动分析平台回报的CD8+T细胞结果进行比较。
结果
不同疾病患者临床回报CD8+T细胞结果与CD8highT细胞的结果趋势一致,与CD8lowT细胞结果不完全一致,差异表现为HIV感染者CD8lowT细胞明显低于健康人(56.2±42.0,68.8±45.9,个/μl,P<0.001),与临床回报CD8+T细胞结果趋势不同。临床回报的CD8+T细胞结果与CD8highT细胞、CD8lowT细胞均具有统计学相关性,其与CD8highT的相关系数明显高于CD8lowT细胞。HIV感染者CD8lowT细胞与CD4+T细胞绝对计数呈正相关趋势(r=0.204,P<0.001),抗病毒治疗后CD8lowT明显高于未治疗组(58.3±43.9,42.9±26.5,个/μl,P<0.001),治疗2年以上患者中,CD4<500个/μl组中CD8lowT细胞明显低于CD4>500个/μl组(50.1±47.0,66.3±46.6,个/μl,P<0.001)。
结论
临床回报CD8+T细胞结果与CD8highT细胞结果趋势一致,与CD8lowT细胞结果存在差异。HIV感染者CD8lowT细胞明显减少,抗病毒治疗可有效重建CD8lowT细胞。(中华检验医学杂志,2018, 41:47-52)
去泛素化酶UCH-L3和自噬基因LC3Ⅱ在急性髓细胞白血病诊断中的临床应用研究王楠 胡丹 袁宏
中华检验医学杂志2018年 41卷 01期
DOI: 10.3760/cma.j.issn.1009-9158.2018.01.012
目的
探讨自噬和UCH-L3在急性髓细胞白血病发生发展过程中的作用机制和相互关系,为白血病的诊断及治疗提供新的靶点和策略。
方法
选取2014至2015年大连医科大学附属第一医院收治的84例AML患者(男47例,女37例)及健康体检对照组25名(男13名,女12名)。AML初发组40例(男24例,女16例),中位年龄54岁(23~85岁);缓解组30例(男14例,女16例),中位年龄45岁(22~74岁);难治组14例(男9例,女5例),中位年龄50岁(18~80岁),其中M1型3例、M2型42例、M3型18例、M4型3例及M5型18例。HL-60细胞采用Real Time PCR及Western Blot法检测TCID处理前后UCH-L3和LC3II的表达变化。AML患者及对照组采用Real Time PCR方法检测外周血单个核细胞UCH-L3和LC3II基因mRNA的表达情况;比较其在初发组、缓解组、难治组及对照组间表达情况;分析AML不同型别之间UCH-L3和LC3II的表达水平;比较AML初发组LC3Ⅱ基因表达的高低与临床特征、临床分期、实验室检查结果及治疗效果的关系。追踪同一患者治疗前后UCH-L3及LC3ⅡmRNA的表达变化。计量资料用t检验,率的比较用χ2检验;相关性分析采用秩相关检验;不符合正态分布的数据用非参数检验。
结果
TCID处理HL-60细胞后,UCH-L3及LC3 II在基因和蛋白水平上与未处理组相比表达均下调,差异有统计学意义(t=-29.435及-8.105,P均<0.05);AML初发组的UCH-L3表达量较健康对照组下调,差异有统计学意义(Z=-3.87,P<0.05);AML缓解组UCH-L3表达量与初发组和难治组相比均高表达,差异有统计学意义(Z分别为-6.70和-4.09,P均<0.05);AML初发组LC3Ⅱ的表达量与健康对照组,缓解组和难治组相比均高表达,差异有统计学意义(Z分别为-6.96、-5.32和-3.52,P均<0.05);LC3Ⅱ高表达组患者细胞遗传学异常更为常见(χ2=6.510,P<0.05);同一患者治疗前后UCH-L3及LC3Ⅱ的相对表达量均有显著差异(t=5.315及-7.353,P均<0.05),经化疗缓解后UCH-L3的表达量较初发治疗前上调,而LC3Ⅱ的表达量下调;初发与缓解组的AML患者各型别间UCH-L3及LC3Ⅱ的相对表达量无差异(F分别为0.014及0.143,P均>0.05)。
结论
UCH-L3和自噬可以通过相互协同作用而调控AML的发生发展。(中华检验医学杂志,2018, 41:53-58)
三种核酸提取方法用于检测血浆EBV-DNA的性能及应用评价郑瑜宏 陈岩松 潘建基 林少俊 肖振州 宗井凤 林莺莺 郭巧娟 许元基 陈燕
中华检验医学杂志2018年 41卷 01期
DOI: 10.3760/cma.j.issn.1009-9158.2018.01.013
目的
评价并比较用于检测血浆EBV-DNA的3种核酸提取方法的分析性能及临床应用价值。
方法
分别采用硅膜离心柱法、浓缩煮沸裂解法或自动化磁珠吸附法平行提取核酸,并通过实时荧光定量PCR测定EBV-DNA。利用第三方定值参考物质,比较三种方法的检测性能,并配对检测100例NPC患者及100名健康体检者血浆,评估3种方法的临床应用价值。
结果
3种方法提取并检测EBV-DNA的正确度、不精密度均符合要求,且对临床样本的测定结果均呈线性相关。但磁珠法的重复性不精密度和中间不精密度较离心柱法与煮沸法均小且稳定(均<3%);最低检测限(约3.334×101 IU/ml)较离心柱法(4.159×101 IU/ml)与煮沸法(8.511×101 IU/ml)稍灵敏;线性范围(5.4×101~5.4×105 IU/ml)较煮沸法(5.4×102~5.4×105 IU/ml)稍宽;抗Hb干扰能力优于煮沸法;而且对NPC样本检测的阳性率及平均病毒载量(95%,8.342×103 IU/ml)均显著高于离心柱法(84%,4.707×103 IU/ml)与煮沸法(78%,2.571×103 IU/ml)(P均<0.05)。
结论
采用自动化磁珠吸附法提取检测血浆EBV-DNA可以实现更好的检测性能,并具备更高的临床应用价值。(中华检验医学杂志,2018, 41:59-65)