恒温扩增实时荧光检测技术在肺结核诊断中的临床价值倪丽丽 罗柳林 景玲杰 张军 陈晋
中华检验医学杂志2012年 35卷 08期
DOI: 10.3760/cma.j.issn.1009-9158.2012.08.011
目的评估RNA恒温扩增实时荧光检测技术(SAT)在临床痰液标本结核分枝杆菌检测中的价值。方法对2011年9至12月上海市肺科医院230例临床确诊肺结核患者和78例其他呼吸系统疾病患者的痰液分别用SAT法、BD960培养法、罗氏培养法和集菌涂片法同时进行检测。SAT法与BD960培养法结果不符标本,再用结核分枝杆菌核酸扩增荧光体外检测试剂盒(PCR-TB)进行检测,同时对BD960培养阳性菌株和SAT扩增产物进行扩增及测序,对菌种进行鉴定。采用χ2检验比较SAT法与上述3种方法对结核病患者的阳性检出率。结果以BD960培养法作为金标准(剔除BD960培养法中有7份污染菌),则SAT方法的敏感度为90.5%(95/105),特异度为84.2% (165/196),阳性预测值为75.4%(95/126),阴性预测值为94.3%(165/175)。SAT法与BD960培养法结果符合率为86.4%(260/301)。223份临床确诊的肺结核患者痰标本SAT法、BD960培养法、罗氏培养法和涂片法的阳性检出率分别为56.5%(126/223)、45.7%(102/223)、41.7%(93/223)和37.2%(83/223),SAT法显著高于其他3种方法,差异有统计学意义(χ2=4.087,P<0.05)。结论SAT技术用于结核分枝杆菌实验室诊断具有特异度高、敏感度好,操作简便、快速,污染率低的特点,有望成为实验室诊断的新方法。(中华检验医学杂志,2012,35:702-705)
临床分离黏质沙雷菌染色体及质粒介导的喹诺酮类耐药机制研究杨海飞 周雪 程君 胡立芬 朱玉林 叶英 李家斌
中华检验医学杂志2012年 35卷 08期
DOI: 10.3760/cma.j.issn.1009-9158.2012.08.012
目的了解安徽地区临床分离株黏质沙雷菌质粒介导喹诺酮类耐药基因的流行情况以及gyrA、parC基因变异对抗菌药物的耐药性产生的影响。方法采用琼脂稀释法测定2005至2010年34家医院收集的104株黏质沙雷菌的MIC;采用PCR检测其中31株耐环丙沙星的黏质沙雷菌的qnr、aac(6′)-Ib、qepA基因以及gyrA和parC基因,对阳性扩增产物进行测序分析;对qnr、aac(6′)-Ib-cr阳性菌株做转移接合试验,PCR扩增并测序确定接合子的基因型,测定供体菌、受体菌和接合子对喹诺酮类及其他类型抗菌药物的MIC。结果共检出31株环丙沙星耐药的黏质沙雷菌,共6株携带qnr基因和(或)aac(6′)-Ib-cr基因,其中2株携带qnrB6亚型,1株携带qnrS2亚型,4株携带aac(6′)-Ib-cr基因(其中1株同时携带qnr基因)。9株检测出gyrA基因突变,7株检测出parC基因突变。6株携带qnr基因和(或)aac(6′)-Ib-cr基因的菌株中有5株转移接合成功。接合子与受体菌相比,对喹诺酮类的MIC值均有不同程度的提高。结论染色体及质粒介导的耐药基因在临床分离的黏质沙雷菌对喹诺酮类药物耐药中起重要的作用,且可以水平传播,故应引起高度重视。(中华检验医学杂志,2012,35:706-710)
下呼吸道分泌物中糠秕马拉色菌的分离与鉴定陈东科 许宏涛
中华检验医学杂志2012年 35卷 08期
DOI: 10.3760/cma.j.issn.1009-9158.2012.08.013
目的对痰涂片镜检可疑为马拉色菌的标本进行马拉色菌的分离培养,并对分离菌株进行系统鉴定。方法收集2010年3月至2011年9月卫生部北京医院经派克墨水染色镜检可疑为马拉色菌的下呼吸道分泌物标本133份,接种于含1%吐温60的科玛嘉琼脂培养基(即改良念珠菌显色培养基),于35 ℃大气环境中培养。挑取疑似菌落在含0.5%吐温40和0.5%吐温60的沙保弱平板上进行纯培养。采用传统的表型鉴定方法对分离菌株进行鉴定,包括染色镜检观察菌体形态及染色性、沙保弱培养基生长试验、吐温试验、七叶苷分解试验、过氧化氢试验、吐温沉淀试验和蓖麻油试验,可疑菌株采用18s rRNA基因序列分析方法对分离菌株进行菌种鉴定。结果镜检可疑的下呼吸道分泌物中马拉色菌分离率为47.4%(63/133),63株分离菌经传统的表型鉴定方法结合18s rRNA基因序列分析方法均鉴定为糠秕马拉色菌。标本直接涂片,用派克墨水染色镜下可明显区分马拉色菌和念珠菌。结论糠秕马拉色菌在改良念珠菌显色培养基上的菌落呈粉红色,可明显区别于其他念珠菌菌落,用改良念珠菌显色培养基可提高下呼吸道分泌物中糠秕马拉色菌的分离率。传统的表型鉴定结合基因序列分析可提高马拉色菌鉴定的准确性。(中华检验医学杂志,2012,35:711-715)
未经碳青霉烯类抗生素治疗患者中检出亚胺培南不敏感铜绿假单胞菌辜依海 朱啸 崔生辉 张军 周庆元 李景云 柴佳
中华检验医学杂志2012年 35卷 08期
DOI: 10.3760/cma.j.issn.1009-9158.2012.08.014
目的通过对未使用碳青霉烯类药物治疗患者中分离的亚胺培南耐药铜绿假单胞菌的分型分析,探讨铜绿假单胞菌对亚胺培南耐药性产生和传播的危险因素。方法2006年4月至2008年3月西安交通大学医学院附属三二〇一医院从未使用碳青霉烯治疗的住院患者中分离出37株亚胺培南不敏感铜绿假单胞菌,采用琼脂稀释法测定了菌株对11种抗生素的敏感性,并通过肉汤稀释法测试了外排泵抑制剂 (PAβN)对亚胺培南和美罗培南耐药性的影响。通过PCR方法对金属酶编码基因及外膜孔蛋白编码基因oprD2进行了扩增和测序,用实时定量PCR(RT-PCR)方法对oprD2和ampC基因的表达水平进行测定, 采用脉冲场电泳技术 (PFGE)分析菌株的同源性。结果37例患者中,体内分离出亚胺培南不敏感铜绿假单胞菌之前,使用两种或两种以上抗生素治疗的16例患者平均抗生素使用时间为(20.0±9.5) d,显著长于仅使用一种抗生素治疗的21例患者[(12.6±4.4) d;t=-2.9004,P<0.01]。在37株菌中,32株对3种以上抗生素耐药;仅有1株菌检出金属酶(IMP-9型),但该菌金属酶表型为阴性;29株菌的oprD2基因上均在同一位点正向插入序列ISpa1328; oprD2表达量检测有35株菌为零表达,2株菌过度表达ampC酶;37株菌PFGE分型分为6个脉冲型,其中26株菌为C2型;所有37株菌在外排泵抑制剂作用下,表现出外排功能。结论氟喹诺酮类和头孢类抗生素是铜绿假单胞菌对碳青霉烯类抗生素不敏感的重要因素。(中华检验医学杂志,2012,35:716-721)
基于DPO的四重荧光PCR检测常见分枝杆菌方法的建立与应用陈光 吴盛海 余道军 徐丽慧 范大鹏 王贤军
中华检验医学杂志2012年 35卷 08期
DOI: 10.3760/cma.j.issn.1009-9158.2012.08.015
结核病是由结核分枝杆菌侵入人体后引起的一种慢性消耗性疾病。据WHO估计,全世界约20亿人已感染结核分枝杆菌[1],结核病成为严重威胁人类健康的感染性疾病之一[2-3]。近年来,非结核分枝杆菌引起的感染逐渐增多,据文献报道我国非结核分枝杆菌分离率由1979年的4.3%升至2000年的11.1%[4]。中国台湾地区非结核分枝杆菌分离率由2000年的32.3%上升到2008年的49.8%[5]。目前痰涂片抗酸染色及细菌培养是诊断结核感染的主要方法,由于涂片阳性率低,特异性差,而细菌培养时间太长,均难以满足临床需求。
P基因片段测序分析HBV基因分型及耐药位点陈爱英 叶锋 刘秀英
中华检验医学杂志2012年 35卷 08期
DOI: 10.3760/cma.j.issn.1009-9158.2012.08.016
目的建立一种高效、准确的HBV基因分型及核苷类药物相关耐药突变位点分析的新方法。方法2011年7至8月在太原市第三人民医院收集48份乙型肝炎患者血清标本,利用商品化核酸提取试剂盒提取标本DNA,然后分别进行HBV全基因组和P基因片段扩增,最后对产物进行测序分析,通过构建系统发生树和Genotyping软件分析两种方法进行基因分型,并对两种扩增产物的分型结果进行比较。结果共得到48条HBV全基因组序列,通过构建系统发生树和Genotyping软件分析两种方法确定12条B型序列和36条C型序列;对HBV P基因片段测序产生的序列进行分型,结果与全基因组测序分析完全一致。通过对HBV P基因序列进行分析,共发现7种核苷类药物耐药突变形式,所测标本突变比例达27.1%(13/48),其中所有突变均与拉米夫定或阿德福韦酯相关,未检测到其他核苷类药物相关耐药突变位点。另外,利用荧光定量PCR法对同样48份标本进行分型检测,共得出B型11例,C型35例,BC混合型2例。结论乙型肝炎病毒P基因片段测序可能是一种新型乙型肝炎病毒分型方法。同时,该方法还可对核苷类药物相关耐药突变进行分析,为乙型肝炎临床治疗提供依据。(中华检验医学杂志,2012,35:726-729)
HRM技术检测β-地中海贫血IVS-2-654(C>T) 与-28(A>G)突变方法的建立及初步应用余玲玲 田可港 冯晶晶 王慧燕 郑美琴 郑晓群 吕建新
中华检验医学杂志2012年 35卷 08期
DOI: 10.3760/cma.j.issn.1009-9158.2012.08.017
目的建立基于高分辨率熔解曲线(HRM)技术快速筛查β-地中海贫血(简称β-地贫)基因突变的方法,并初步探讨其临床应用价值。方法选取温州地区人群β-地贫常见基因突变位点IVS-2-654(C>T)与-28(A>G)作为研究位点,采用TA克隆技术构建其质粒DNA作为模板或基因分型对照,建立基于HRM技术检测β-地贫基因突变的方法,并对该方法的特异性、重复性、灵敏度等指标进行方法学评价。收集2009年11月至2010年10月温州医学院附属第二医院、育英儿童医院临床疑似β-地贫患者117例,抽取外周血标本,提取外周血白细胞DNA,用该方法进行IVS-2-654(C>T)与-28(A>G)位点的HRM检测,并将检测结果与双向直接测序做比较。结果建立的HRM技术可对β-地贫IVS-2-654(C>T)与-28(A>G)突变位点进行检测,未见非特异性扩增片段;不同基因型HRM检测的批内、批间熔解温度(Tm)值的变异系数(CV)均<0.1%;该法最低可检出103拷贝的DNA模板,并可检测低至10%的突变存在。117份临床疑似β-地贫患者样本经该法检测,45份为IVS-2-654(C>T)杂合突变型,9份为-28(A>G)杂合突变型,未发现2个位点的纯合突变型基因;此结果与直接测序所得基因型结果完全一致。结论建立的HRM技术操作简便,特异性强,灵敏度高,可用于β-地贫基因突变筛查,并为β-地贫其他突变位点的检测及基因组单核苷酸多态性分型等提供了一个通用的技术平台。(中华检验医学杂志,2012,35:730-735)
胃泌素释放肽前体对小细胞肺癌的诊断价值杨兴 孙桂荣 丛培珊 宗金宝 李海霞 刘明军
中华检验医学杂志2012年 35卷 08期
DOI: 10.3760/cma.j.issn.1009-9158.2012.08.018
目的评估分析血清胃泌素释放肽前体(ProGRP)对小细胞肺癌(SCLC)的临床诊断价值。方法用化学发光法和电化学发光法检测2010年9月至2011年4月期间,青岛大学医学院附属医院46例初诊SCLC(局限期26例、广泛期20例)、51例非小细胞肺癌(NSCLC)、45例肺良性疾病患者及56名健康体检者血清ProGRP和神经元特异性烯醇化酶(NSE)水平,以受试者工作特征(ROC)曲线确定ProGRP和NSE诊断SCLC的临界值及曲线下面积(ROC-AUC),评估2项指标诊断SCLC的敏感度和特异度。结果健康对照组、肺良性疾病组、NSCLC组和SCLC组血清ProGRP水平分别为22.9(19.5~28.7)、23.7(20.0~27.8)、28.9(23.8~34.7)和370.9(129.4~1951.6) ng/L;血清NSE水平分别为14.1(12.5~15.7)、13.3(10.3~15.3)、16.8(11.7~22.1)和39.9(16.1~93.9) μg/L;经非参数Kruskal-Wallis H检验,各组间ProGRP和NSE的差异均有统计学意义(H值分别为92.116和55.481,P均<0.001)。局限期SCLC (LD-SCLC)组血清ProGRP[156.2(65.4~547.5) ng/L]也高于健康对照组、肺良性疾病组和NSCLC组(U值分别为57、70和144,P均<0.001)。广泛期SCLC (ED-SCLC)组血清ProGRP和NSE为[1933.1(325.9~4512.1) ng/L和61.0(35.4~115.5) μg/L],均高于LD-SCLC组ProGR和NSE[24.3(15.1~61.3) μg/L,U值分别为119和153,P均< 0.05]。以健康组为对照,ROC曲线上取约登指数最大点确定ProGRP和NSE的临界值分别为34.0 ng/L和20.2 μg/L,SCLC组ProGRP的ROC-AUC(0.96)较NSE(0.86)明显增高(Z=2.57,P<0.05);ProGRP和NSE联合检测的ROC-AUC(0.96)与ProGRP单项检测(0.96)比较,差异无统计学意义(Z=0.21,P>0.05)。ProGRP的敏感度(89.1%)也高于NSE(71.7%, χ2=4.90,P<0.05);其特异度(98.2%)与NSE比较的差异无统计学意义(96.4%, χ2=0.00,P>0.05);ProGRP和NSE联合检测的敏感度和特异度与ProGRP单项检测比较,差异无统计学意义(91.3%比89.1%,94.6%比98.2%, χ2均为0.00,P>0.05)。以肺良性疾病组为对照,ROC曲线上取约登指数最大点确定ProGRP和NSE的临界值分别为49.5 ng/L和23.1 μg/L,SCLC组ProGRP的ROC-AUC(0.95)比NSE(0.87)明显升高(Z=1.99,P<0.05);ProGRP和NSE联合检测的ROC-AUC(0.95)与ProGRP单项检测(0.95)比较,差异无统计学意义(Z=0.02,P> 0.05)。ProGRP的敏感度(84.8%)也高于NSE(69.6%, χ2=4.00,P<0.05);其特异度(97.8%)与NSE比较,差异无统计学意义(97.8%, χ2=0.50,P>0.05);ProGRP和NSE联合检测的敏感度和特异度与ProGRP单项检测比较,差异无统计学意义(87.0%比84.8%,95.6%比97.8%, χ2均为0.00,P>0.05)。以NSCLC组为对照,ROC曲线上取约登指数最大点确定ProGRP和NSE的临界值分别为49.1 ng/L和23.0 μg/L,SCLC组ProGRP的ROC-AUC(0.90)较NSE(0.76)明显升高(Z=2.90,P<0.05);ProGRP和NSE联合检测的ROC-AUC(0.90)与ProGRP单项检测(0.90)比较,差异无统计学意义(Z=0.00,P>0.05)。ProGRP的敏感度(84.8%)也高于NSE(69.6%, χ2=4.00,P<0.05),其特异度(96.1%)与NSE也明显升高(80.4%,χ2=6.13,P<0.05);ProGRP和NSE联合检测的敏感度和特异度与ProGRP单项检测比较,差异无统计学意义(87.0%比84.8%,95.6%比96.1%,χ2均为0.00,P>0.05)。结论ProGRP用于诊断SCLC较好,其比NSE对SCLC有更高的辅助诊断价值。(中华检验医学杂志,2012,35:736-741)
两种检测抗双链DNA抗体方法对系统性红斑狼疮的诊断价值比较史晓敏 阎振林 隋宝环 冯珍如
中华检验医学杂志2012年 35卷 08期
DOI: 10.3760/cma.j.issn.1009-9158.2012.08.019
目的探讨间接免疫荧光法(IIF)和酶联免疫吸附法(ELISA)同时检测对于系统性红斑狼疮(SLE)诊断的价值。方法回顾性研究,回顾北京大学第一医院2011年6月1日至9月30日所有抗dsDNA抗体检测的病例2712例,记录每份病例的抗dsDNA抗体检测结果及其临床诊断。计算IIF和ELISA方法检测敏感度、特异度,运用Kappa检验进行一致性检验。结果ELISA方法检测抗dsDNA抗体的阳性率(16.3%)要略高于IIF方法(13.1%),但二者的总体结果基本一致(Kappa=0.641,P<0.05)。在不一致(9.2%)中以IIF法阴性同时ELISA法阳性多见(6.2%)。以SLE的临床诊断为金标准,IIF与ELISA检测结果诊断SLE的准确性分别为84.8%和 84.4%,差异无统计学意义(χ2=0.25, P>0.05)。IIF诊断SLE的敏感度和特异度为46.1%和99.2%,ELISA诊断SLE的敏感度和特异度为51.3%和96.7%。结论应将IIF和ELISA 2种方法同时应用于抗dsDNA抗体的检测。若先用ELISA筛查,阳性标本再加测IIF,会将至少3.0%的ELISA阴性IIF阳性标本误判为阴性。IIF阴性ELISA阳性标本应进一步检测抗dsDNA抗体亲和力来辅助SLE的诊断和病情评估。(中华检验医学杂志,2012,35:742-745)